FlowJo流式數(shù)據(jù)分析常見術(shù)語整理！

FlowJo是美國斯坦福大學(xué)Leonard Herzenberg（FACS機(jī)器的發(fā)明者）實(shí)驗(yàn)室在90年代研發(fā)的一款流式數(shù)據(jù)分析軟件。FlowJo由于功能強(qiáng)大，簡(jiǎn)單易用，已經(jīng)被領(lǐng)域內(nèi)的科學(xué)家、實(shí)驗(yàn)室廣泛引用；同時(shí)FlowJo也是各高影響力核心期刊引用最多的流式數(shù)據(jù)分析軟件。但是在使用FlowJo進(jìn)行流式數(shù)據(jù)分析的時(shí)候，有些術(shù)語的含義非常常見，但是其具體含義又是什么呢？在這里簡(jiǎn)單做一些總結(jié)，總結(jié)一些常見術(shù)語，供大家參考。

參數(shù)圖

1-1

一維直方圖Histogram

每一個(gè)細(xì)胞單參數(shù)的測(cè)量數(shù)據(jù)可以整理成統(tǒng)計(jì)分布，以直方圖的方式來顯示。在圖中，橫坐標(biāo)表示熒光信號(hào)或散射光信號(hào)相對(duì)強(qiáng)度的值，其單位是道數(shù)，可以是線形（line）或者對(duì)數(shù)（log）。縱坐標(biāo)一般是細(xì)胞數(shù)（count）。??

1-2

二維散點(diǎn)圖Dot Plot

在二維圖的中，橫坐標(biāo)/縱坐標(biāo)都表示熒光信號(hào)或散射光信號(hào)相對(duì)強(qiáng)度的值，可以是線形（line）或者對(duì)數(shù)（log）。雙參數(shù)圖可以將樣品細(xì)胞群分開，常用來分析多參數(shù)數(shù)據(jù)。?

1-3

其它參數(shù)圖

?

Density(密度圖）

?Contour(等高線圖）

?門“Gate”

2-1

門的形式

區(qū)域（region，R）

標(biāo)記（Marker）

“十”字形（Quant)

2-2

定義“門”的方法（Gates）

(1）門的3種組合：and; or; not(eg.Gate4=Gate1 or Gate2 or Gate3)?

（2）Convert Marker To Gate(eg.M1=Gate 5)?

（3）Convert Quads To Gates?

數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

統(tǒng)計(jì)方式：百分比（%）&熒光強(qiáng)度（MFI）

（1）百分比（%）：一種細(xì)胞占樣本中所有細(xì)胞的比例?

（2）熒光強(qiáng)度（MFI）：Median=164.74所對(duì)應(yīng)的值跟細(xì)胞表面受體個(gè)數(shù)正相關(guān)。

Mean：平均熒光強(qiáng)度；Median：熒光強(qiáng)度的中位數(shù)；Mode：眾數(shù)，是一組數(shù)據(jù)中出現(xiàn)次數(shù)最多的數(shù)值；Geometric mean：幾何平均數(shù)，是指n個(gè)觀察值連乘積的n次方根，計(jì)算公式為：?

4-1

?峰圖疊加（Overlay）

方式一??

???????????????方式二

4-2

點(diǎn)圖疊加（Overlay）

05

擬合

5-1

模擬分析——細(xì)胞增殖

5-2

模擬分析——細(xì)胞周期

5-3

劑量效應(yīng)